У ході виконання федерального бюджету Уряд РФ має право вносити зміни у відомчу структуру витрат федерального бюджету у зв’язку з передачею повноважень по фінансуванню окремих установ, заходів або видів витрат.
Федеральний фонд фінансової підтримки суб’єктів РФ в 1998 р. формувався за рахунок 14% загального розміру податкових доходів, що надходять у федеральний бюджет, крім доходів від мит, митних зборів й інших митних платежів, а також доходів цільових бюджетних фондів.
В 1998 р. у межах асигнувань, затверджених по відповідних розділах і підрозділам функціональної класифікації витрат федерального бюджету, провадилося фінансування на умовах зворотності й платності наступних заходів:
• витрат на забезпечення агропромислового комплексу машинобудівною продукцією й придбання племінної худоби на основі договорів фінансової оренди - лізингу;
• витрат на сезонне кредитування підприємств й організацій агропромислового комплексу;
• закупівель сільськогосподарської продукції у Федеральний продовольчий фонд на конкурсній основі в обсязі потреб, які не можуть бути забезпечені ринковими механізмами;
• витрат на сезонну закупівлю сировини й матеріалів для виробництва товарів народного споживання й товарів виробничо-технічного призначення текстильної й легкої промисловості;
• витрат на створення межсезонных запасів деревини, сировини й палива для підприємств лісової промисловості;
• витрат на розвиток межфермерской кооперації;
• витрат на здійснення високоефективних інвестиційних проектів, розташовуваних на конкурсній основі;
• витрат на інвестиційні програми конверсії оборонної промисловості, інвестиційні проекти створення робочих місць для працівників вугільної галузі, що вивільняють, а також фінансування Федеральної цільової програми «Свій будинок»;
• витрат на виконання високоефективних прикладних науково-технічних розробок.
Уряд РФ видавало з федерального бюджету органам виконавчої влади суб’єктів РФ безпроцентні бюджетні позички на строк, що не перевищує меж фінансового року, на наступні цілі: