• стягує із всіх рахунків бюджетні кошти, видані у формі бюджетних позичок, бюджетних кредитів, по яких минув строк повернення, а також відсотки, що підлягають сплаті за користування бюджетними позичками, бюджетними кредитами;
• накладає на головних розпорядників, розпорядників й одержувачів коштів федерального бюджету, кредитні організації штрафи в межах своєї компетенції;
• веде зведений реєстр головних розпорядників, розпорядників й одержувачів коштів федерального бюджету й здійснює реєстрацію бюджетних установ, діяльність яких фінансується з коштів федерального бюджету;
• здійснює інші повноваження відповідно до бюджетного законодавства.
Федеральне казначейство відповідає за:
• правильність виконання федерального бюджету, ведення рахунків і керування бюджетними коштами;
• фінансування витрат, пов’язаних з наданням бюджетних позичок, бюджетних інвестицій, державних гарантій;
• повноту й своєчасність перерахування й зарахування бюджетних коштів на рахунки їхніх одержувачів;
• своєчасність подання звітів й інших відомостей, пов’язаних з виконанням бюджету;
• своєчасність доведення повідомлень про бюджетні асигнування й ліміти зобов’язань бюджету до одержувачів бюджетних коштів; фінансування витрат, не включених у бюджетний розпис; фінансування витрат понад затверджені ліміти зобов’язань бюджету;
• здійснення контролю за дотриманням бюджетного законодавства головними розпорядниками, розпорядниками й одержувачами бюджетних коштів, кредитними організаціями;
• виконання приписань Рахункової палати РФ і рішень актів судових органів про компенсації збитку, нанесеного фінансовими органами одержувачам бюджетних коштів.
Федеральне казначейство може здійснювати виконання бюджетів суб’єктів РФ і місцевих бюджетів по ув’язнених з відповідними органами виконавчої влади й органами місцевого самоврядування угодам. Повноваження органів Федерального казначейства поширюються на організації, включаючи кредитні організації, що здійснюють операції з коштами відповідних бюджетів в обсязі наявних повноважень стосовно до коштів федерального бюджету.