Організації, яким відкриті особові рахунки в органах Федерального казначейства, представляють розрахунково-грошові документи на фінансування своїх витрат відповідно до затвердженого кошторису. Ліміти бюджетних коштів й їхнє бюджетне призначення доводять до власників особових рахунків органами Федерального казначейства.
Прийом, оформлення й відбиття по рахунках бухгалтерського обліку розрахунково-грошових документів провадяться в день їхнього надходження в орган Федерального казначейства протягом першої половини робочого дня в операційний день.
Оплата всіх розрахунково-грошових документів власників особових рахунків, включаючи виплату заробітної плати, розрахунки з бюджетом, державними позабюджетними фондами, інші платежі, провадиться з їхніх особових рахунків у межах наявних коштів, з дотриманням законодавства в частині черговості платежів і календарної черговості надходження розрахункових документів.
Органи Федерального казначейства щодня одержують від установ банків виписки по поточному бюджетному рахунку із прикладеними до них платіжними документами: платіжними, інкасовими дорученнями, меморіальними ордерами, квитанціями на здачу готівки - по зроблених розрахунково-касових операціях.
Зарахування, що надійшли від вищестоящого органа Федерального казначейства коштів на поточний бюджетний рахунок органа Федерального казначейства провадиться установою банку на підставі платіжних доручень і реєстрів.
Що надійшли й зараховані на особові рахунки організацій кошти, призначені на фінансування витрат федерального бюджету, використаються в строгій відповідності із затвердженими кошторисами й бюджетними призначеннями, зазначеними в реєстрах.
По закінченні фінансового року, перед складанням річного звіту, бухгалтерія органів Федерального казначейства перевіряє вірогідність всіх балансових рахунків і розрахунків з розпорядниками асигнувань федерального бюджету й з органами Федерального казначейства по коштам, отриманим і переданим на фінансування витрат по їхньому змісті й проведенню різних федеральних заходів.